Η όποια παρέκκλιση από μια αυστηρή ρουτίνα υγιεινής μπορεί να αυξήσει την πιθανότητα μικροβιακής μόλυνσης σε χρήστες φακών επαφής.

Μία πρόσφατη έρευνα σε 119 χρήστες, αναφέρθηκε ότι η παρουσία σημαντικού αριθμού βακτηρίων αυξανόταν με συγκεκριμένες συνήθειες -μη- υγιεινής. Τα 2/3 (66%) των θηκών βρέθηκαν θετικά για βακτηριακή ή μυκητιακή μόλυνση, ειδικά όσων φορούσαν φακούς πάνω από 2 χρόνια, δείχνοντας ότι οι παλαιοί χρήστες τείνουν να γίνονται πιο απρόσεκτοι. Οι ερευνητές βρήκαν ότι βασικά βήματα για την μείωση της μόλυνσης είναι το σωστό πλύσιμο χεριών με σαπούνι πριν τον χειρισμό των φακών επαφής, ξέπλυμα της θήκης με υγρό καθαρισμού των φακών, το να αφήνουμε την θήκη να στεγνώνει με τον αέρα όταν είναι άδεια και η χρήση της προτεινόμενης από τον κατασκευαστή του υγρού μας θήκης.